Zajedničke jedinice za znanstvenu potporu ustrojene su radi centraliziranog pristupa i upravljanja vrijednim istraživačkim resursima Instituta (prostor, znanstvena oprema, eksperimentalni nasadi i kolekcije biljnog genofonda, zaštićeni objekti i slično) od šireg interesa za zaposlenike Instituta odnosno akademsku zajednicu, a koji resursi su suviše skupi, složeni ili specijalizirani da bi pojedini zaposlenici, laboratoriji ili zavodi mogli samostalno organizirati njihovo korištenje (pružanje usluga) na dugoročno održiv način.
U glavnoj zgradi Instituta, u Duilovu, nalaze se laboratoriji opremljeni prema potrebama istraživačkih aktivnosti (vinogradarstvo i vinarstvo, pedologija, ishrana bilja, voćarstvo, povrćarstvo, prerada voća i povrća, kultura biljnih tkiva, zaštita bilja, molekularna biologija i mikrobiologija). Vrijedna (kapitalna) znanstvena oprema smještena je u laboratorijima i zatvorenim vegetacijskim prostorima.
Centar za pokušališta i kolekcije
Unutar Zajedničkih jedinica za znanstvenu potporu ustrojen je Centar za pokušališta i kolekcije pomoću kojih Institut na svojim dobrima održava kolekcije autohtonih, udomaćenih i introduciranih biljnih vrsta. Oko zgrade Instituta nalaze se pokusne površine (staklenici i plastenici - 1,3 ha; jednogodišni i višegodišnji nasadi - 1 ha). Na pokusnom dobru Kaštel Stari, površine 5 ha, nalazi se eksperimentalna uljara i višegodišnji nasadi.