Znanstvena djelatnost Zavoda za šumarstvo usmjerena je na istraživanje mediteranskih šuma i razvoj održivih rješenja za njihovu zaštitu, obnovu i dugoročno upravljanje. Kroz interdisciplinarne pristupe proučavaju se utjecaji klimatskih promjena i okolišnih pritisaka na stabilnost i otpornost šumskih ekosustava mediteranskog područja.
Istraživanja obuhvaćaju utjecaj klimatskih i okolišnih promjena na strukturu i funkcije mediteranskih šuma, prilagodbu ekosustava promjenjivim uvjetima te procese degradacije i erozije tla, uključujući promjene na opožarenim površinama i pod različitim tipovima vegetacije. Aktivnosti uključuju obnovu degradiranih i opožarenih šumskih područja, pošumljavanje autohtonim vrstama, uzgoj šumskih sadnica i pripremu tla za pošumljavanje. Uz navedeno, provodi se analiza utjecaja atmosferskog taloženja na šumske i vodne sustave, što omogućuje bolje razumijevanje otpornosti i dugoročne održivosti mediteranskih šuma.
Zavod sudjeluje u nacionalnim i međunarodnim projektima usmjerenima na jačanje znanstvene djelatnosti i razvoj suvremenih metoda održivog gospodarenja šumama. Suradnja s istraživačkim institucijama i uključivanje u europske programe omogućuju primjenu najnovijih znanstvenih spoznaja i razvoj rješenja koja povezuju znanost i praksu.
Uz znanstveni rad, Zavod izrađuje stručne podloge, studije i analize te pruža savjetodavnu podršku javnim i državnim institucijama, lokalnoj zajednici i drugim dionicima u području šumarstva. Time Zavod doprinosi prilagodbi šumskih ekosustava i šumarskog sektora suvremenim izazovima.